En un artículo reciente publicado en el Diario de Virología Clínica Pluslos investigadores evalúan el rendimiento de un ensayo de uso exclusivo en investigación (RUO) para identificar la infección viral por Mpox.
Estudiar: Investigación de infección por Mpox mediante diagnósticos sindrómicos multiplexados: evaluación de un panel sindrómico de PCR en tándem multiplexado (MT-PCR) de AusDiagnostics. Haber de imagen: PolakPhoto/Shutterstock.com
Diagnóstico de mopox
Después de alcanzar el número máximo de casos en el Reino Unido en julio de 2022, la prevalencia de casos de Mpox continúa disminuyendo. Sin embargo, el brote de Mpox de 2022 fuera de las áreas endémicas mostró que este virus probablemente causa una enfermedad de erupción viral similar a otros virus.
El reciente brote demostró que ácido nucleico Las pruebas de amplificación (NAAT) son insuficientes para detectar el genoma de Mpox en muestras de pacientes, lo que sugiere que el virus Mpox debería incorporarse ahora en paneles sindrómicos multiplexados.
En el estudio actual, los investigadores evalúan el rendimiento de un panel sindrómico de ROU llamado AusDiagnostics Multiplexed Tandem Polymerase Chain Reaction (MT-PCR). MT-PCR detecta un objetivo del virus Mpox además de un panel de varios patógenos que también causan erupción vesicular e infectan el sistema nervioso central (SNC).
Los investigadores compararon la utilidad de MT-PCR con la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) para identificar la presencia de patógenos distintos de Mpox al principio del brote y paneles de muestras contemporáneos.
Sobre el estudio
Se obtuvieron dos conjuntos de muestras de hisopos de vesículas de pacientes que requerían la detección del genoma del virus Mpox para la atención clínica de rutina. Las muestras del panel 1 comprendían ácidos nucleicos residuales enviados para la detección del virus Mpox en el Laboratorio de patógenos raros e importados (RIPL) en el Reino Unido entre el 15 de mayo de 2022 y el 24 de junio de 2022, que fue temprano en el reciente brote de Mpox.
Las muestras del panel 2, que también se denominaban muestras contemporáneas, comprendían ácidos nucleicos residuales enviados para la detección del virus Mpox mediante la prueba desarrollada en laboratorio de qPCR (MPOX LDT) entre el 30 de agosto de 2022 y el 5 de septiembre de 2022.
Se realizó MT-PCR en las muestras como parte de un panel multiplexado integral con 15 objetivos de patógenos, algunos de los cuales incluían el virus del herpes humano 1, 2 y 6. El ensayo se centró en el gen F3L del genoma del virus Mpox y requirió 10 µL de ácido nucleico. material ácido y un solo juego de reactivos. Se calcularon los porcentajes de concordancia positivos y negativos (PPA y NPA, respectivamente), además de determinar la precisión general del ensayo AusDiagnostics MT-PCR Mpox.
Hallazgos del estudio
De las 175 muestras analizadas, el ensayo MT-PCR detectó el genoma del virus Mpox en el 21,9 % del panel 2 y el 51,1 % de las muestras del panel 1. También se detectaron conjuntamente varios otros patógenos que causan síndromes de erupción vesicular en casos de Mpox.
El panel AusDiagnostics RUO MT-PCR se asoció con una precisión del 98,9 %, una sensibilidad del 94,2 % y una especificidad del 100 %. Su rendimiento fue comparable a un ensayo LDT qPCR utilizado para detectar el virus Mpox en ácidos nucleicos extraídos de muestras de hisopos. En consecuencia, el ensayo tenía un límite de detección (LOD) de 35 copias del genoma Mpox en muestras de ácido nucleico residual.
El ensayo MT-PCR Mpox arrojó un umbral de ciclo (CT) valores dentro del rango de 9,58 y 35,07, con una media de 17,2. Estos valores son ligeramente inferiores pero cercanos a los resultados obtenidos a través de una qPCR Mpox LDT.
Además del virus Mpox, el ensayo MT-PCR permitió analizar las muestras en busca de cinco patógenos adicionales que habitualmente causan una erupción vesicular. En 18 y 29 muestras de los paneles 1 y 2, respectivamente, que por lo demás representaban el 26,8 % del total de muestras, el ensayo detectó al menos uno de esos patógenos.
Conclusiones
El laboratorio donde el equipo recolectó muestras de prueba era una ubicación geográfica que se vio excesivamente afectada durante el brote de Mpox en el Reino Unido. Por lo tanto, los valores informados en el estudio actual no reflejan la prevalencia viral de Mpox observada en otros lugares.
Los laboratorios clínicos no realizaron pruebas de diagnóstico en el 13,7% de las muestras infectadas con un patógeno atribuible a una erupción vesicular. El ensayo MT-PCR detectó conjuntamente el virus Mpox con otros patógenos de erupción vesicular en el 12,8 % de las muestras, siendo el enterovirus el detectado con mayor frecuencia en el 5,7 % de las muestras.
En medio del brote de Mpox, otros patógenos virales que causan un síndrome de erupción vesicular también siguieron siendo frecuentes en varios pacientes, lo que destaca las ventajas asociadas con el uso de paneles multiplexados que se están evaluando. Por lo tanto, los diagnósticos de Mpox podrían integrarse fácilmente en paneles sindrómicos multiplexados y usarse para controlar infecciones en áreas donde el virus Mpox es endémico. Además, los laboratorios de virología clínica podrían beneficiarse de los paneles sindrómicos multiplexados que alivian la necesidad de múltiples ensayos de un solo patógeno.
Referencia de la revista:
- Pond, MJ, Al-Mufti, J., Madona, P., et al. (2023). Investigación de infección por Mpox mediante diagnósticos sindrómicos multiplexados: evaluación de un panel sindrómico de PCR en tándem multiplexado (MT-PCR) de AusDiagnostics. Revista de Virología Clínica Plus. doi:10.1016/j.jcvp.2023.100142
