Innovación que está transformando la espectrometría de masas de las ciencias de la vida


Obtenga información sobre el enfoque innovador de Bruker para la espectrometría de masas de ciencias biológicas de Rohan Thakur, presidente de espectrometría de masas de ciencias biológicas, en el episodio debut de la serie de podcasts omg OMx. Descubra cómo Bruker está aprovechando su impulso y aprovechando nuevas oportunidades en el campo, y explore las soluciones innovadoras que están revolucionando el futuro de la espectrometría de masas. Vuelva a visitar los aspectos más destacados del episodio y vea el episodio completo a pedido.

Como actor dominante en el espacio de la espectrometría de masas por resonancia magnética (MRMS), ¿cómo ha cambiado la introducción de la tecnología de espectrometría de movilidad de iones atrapados (TIMS) la posición de Bruker en el mercado de la espectrometría de masas?

Todo comenzó con lo que pensamos que era una tecnología disruptiva que creíamos que podría revolucionar el mercado de la proteómica y competir con las tecnologías establecidas.

Nuestro equipo vio el potencial de Tecnología de espectrometría de movilidad de iones atrapados (TIMS). Sabíamos que podría revolucionar el mercado de la proteómica y competir con las tecnologías establecidas que ya existen. Quiero decir, la mayoría de las ejecuciones de LC en el campo de la proteómica tardan una eternidad: estamos hablando de unas 2 horas en promedio. pero con el timsTOF y su acumulación paralela-fragmentación serial (PASEF®), ¡podemos obtener la misma cantidad de información en solo 20 minutos! Es un cambio de juego absoluto.

Una vez que supimos que teníamos esta velocidad en la que podíamos generar muchas muestras al día, obtuvimos el software para ayudar a convertir estos archivos de datos en conocimiento procesable. Es cuando PaSER Fue presentado. Ahora, por primera vez, tuvimos innovación en hardware y pudimos brindar información a nuestros usuarios justo después de cerrar el archivo.

Estas dos cosas juntas: el rápido aumento en la cantidad de muestras analizadas por día y los datos que podían analizarse tan pronto como finalizaba la ejecución fueron una verdadera innovación en un campo que ha estado estancado durante aproximadamente 15 años.

Rohan Thakur | Dios mío OMx Podcast | ep. 1

¿Cómo ha contribuido Bruker a los avances recientes en la proteómica del plasma?

nos atrae [plasma proteomics] porque los productos de fuga de los tumores se pueden encontrar en el plasma. Por eso adquirimos PreOmics, una empresa de preparación de muestras, y ahora tenemos un producto que nos permite analizar las muestras rápidamente. En algunas aplicaciones de la proteómica del plasma, podemos observar de 200 a 300 proteínas en solo 5 minutos. Eso es bastante impresionante, especialmente cuando considera que en un entorno clínico o de investigación, desea que los datos se procesen y analicen rápidamente. No puede esperar semanas para que se entreguen los datos.

la velocidad de PASEFtecnología TIMS, combinada con nuestra PaSER paquete, nos permite analizar muchas muestras al día y obtener información que se puede utilizar para tomar una decisión o brindar asesoramiento como prueba secundaria. También tenemos algunos usuarios realmente impresionantes: el Dr. Roman Fisher en Oxford, Matthias Mann en Copenhague y Alain Van Gool en Radboud son solo algunas de las personas que usan nuestros sistemas. Es emocionante ver el impacto que nuestros sistemas están teniendo en el campo y estamos orgullosos de ser parte de ello.

¿Cuál es la importancia de colaborar cuando se está a la vanguardia de los avances científicos en el campo y cómo se siente ser parte de tales avances?

Nuestro enfoque es escuchar y trabajar de cerca con los expertos en el campo. Es un esfuerzo de equipo. Estos primeros usuarios nos guían sobre dónde llevar la tecnología. Tenemos la tecnología que podría ayudar, ahora la pregunta es: ¿cuál es la relevancia biológica de la tecnología?

Vemos a estos primeros usuarios y líderes de opinión clave (KOL) como los verdaderos pioneros en la vanguardia de la industria. Y estamos aquí para apoyarlos en su trabajo para resolver problemas complejos en oncología y biología. Sus comentarios nos ayudan a diseñar instrumentos y capacidades que satisfagan sus necesidades específicas. En última instancia, nuestro objetivo es mejorar el trabajo que están haciendo y tener un impacto significativo en el campo.

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Crédito de la imagen: Espectrometría de masas de Bruker Life Sciences

¿Ha tenido personalmente algún momento impresionante mientras aprendía sobre las posibles aplicaciones de esta tecnología?

Uno de los mejores momentos para mí fue cuando un buen amigo mío, Roman Fisher, me envió una foto de 96 placas de pocillos apiladas hasta la parte superior de la timsTOF y dijo: “Mira Rohan, este es el impacto que tu producto ha tenido en nuestra vida diaria”.

Fue uno de esos momentos en los que pensé: “¡Guau, en realidad lo logramos!”. Por primera vez, pudo cortar entre 5000 y 6000 muestras sin tener que limpiar su espectrómetro de masas. Eso fue un gran logro para nosotros.

Ver esa imagen y saber que habíamos diseñado un espectrómetro de masas robusto que podía manejar ese tipo de carga de trabajo fue realmente emocionante. Definitivamente fue un momento “omg” para mí.

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Crédito de la imagen: Espectrometría de masas de Bruker Life Sciences

¿Qué piensa sobre el rápido crecimiento y el éxito de la proteómica espacial y las ómicas en general en Bruker?

Eso viene nuevamente de escuchar a uno de nuestros KOL, Matthias Mann, quien nos ayudó a lograr un gran avance. Matthias y su equipo utilizan técnicas visuales profundas para evaluar tumores e identificar las proteínas que contienen. Utilizan una técnica llamada microdisección de captura láser para observar más de cerca las células individuales dentro del microambiente tumoral.

Tuvimos un debate interno sobre si ir sin etiquetas o usar etiquetas en nuestro MALDI Las técnicas de imagen y nuestra colaboración con AmberGen nos ayudaron a decidir. Ahora tenemos una técnica poderosa, y la única pregunta que queda es si podemos lograr la sensibilidad requerida para seguir proteínas con enfoques LCMS altamente sensibles a enfoques MALDI.

Estoy entusiasmado de que estemos en condiciones de ofrecer a nuestros clientes lo mejor de ambos mundos. Podemos observar proteínas dentro de una sola célula y podemos conectar las dos técnicas para beneficiar a nuestros usuarios. Nuestros clientes nos han estado pidiendo que hagamos esto, y creo que estamos viviendo en una era maravillosa en la que podemos hacer que esto suceda. ¡No puedo esperar a ver los resultados que surgirán de esta colaboración!

¿Hay algún científico o investigador en el campo que admire pero que aún no haya tenido la oportunidad de conocer? ¿Quién es tu “enamorado de la ciencia”, por así decirlo, alguien a quien admiras y crees que podría tener un gran impacto en el futuro de la ciencia?

Bueno, soy un veterano en este campo, así que tuve el placer de conocer y aprender de algunos de los nombres más importantes como John Yates, Matthias Mann y Albert Heck. Ha sido una carrera satisfactoria hasta ahora. ¿Pero sabes lo que realmente me emociona estos días? Es la idea de cerrar la brecha entre la espectrometría de masas y la práctica clínica. Quiero saber de los oncólogos y entender realmente cómo podemos hacer que la espectrometría de masas sea una herramienta de rutina en la clínica, al igual que la genómica. Si podemos hacer que eso suceda, sería un cambio de juego.

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Crédito de la imagen: Espectrometría de masas de Bruker Life Sciences

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Sobre el altavoz

Rohan Thakur, Ph.D., presidente de espectrometría de masas de ciencias biológicas en Bruker

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Rohan Thakur, Ph.D., presidente de Life Sciences Mass Spectrometry en Bruker, se unió a Bruker en 2010 como Gerente General del equipo CAM MS en Fremont, CA, y fue ascendido en consecuencia a Vicepresidente de Negocios Cuadrupolo y Vicepresidente Senior dentro de sus primeros cinco años. años antes de asumir su nuevo cargo. Tiene más de 20 años de experiencia en espectrometría de masas, incluidos 14 años en aplicaciones y desarrollo de MS, y también es propietario de varias patentes en el campo de la espectrometría de masas. Durante su carrera, ocupó cargos como director de marketing global para soluciones de espectrometría de masas en Thermo Scientific. Fue Director de Descubrimiento de Fármacos en una CRO farmacéutica durante 2 años antes de unirse a Bruker. Recibió su Ph.D. en Química de la Universidad Estatal de Kansas. Realizó estudios postdoctorales en la Universidad de Rutgers, donde su trabajo involucró el uso de análisis MS de alta resolución para probar la formación de aductos de proteínas y metabolitos de benceno con anillo abierto.

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omg OMx host: Kate Stumpo, gerente sénior de mercado en Bruker

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Esta información se obtuvo, revisó y adaptó a partir de materiales proporcionados por Bruker Daltonics.

Para obtener más información sobre esta fuente, visite Espectrometría de masas Bruker Life Sciences.



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